「台南市政府推動十大旗艦計畫」是大台南市長賴清德上任後的施政主軸，其首項即投資大台南計畫，積極發展六大新興科技產業，協助推動產業升級，營造良好投資環境，生技、綠能就是其中兩大產業聚落，綜觀台南縣市合併升格後，已引進3,000億元總投資金額，因此創造就業機會，加快促進大台南經濟繁榮發展。
挾兩大科技重鎮優勢
分析台灣生技、綠能兩大產業能夠蓬勃發展，挾其擁有台南科學工業園區（南科）與台南科技工業區（南科工）兩大科技重鎮，以及合併後大台南各工業區熱賣，周邊產業相繼湧入的等優勢，生技與綠能產業不斷茁壯深根，以下台南是市長賴清德，所勾劃的兩大產業願景。
賴清德指出，在生技產業方面，近年來由於台灣的生技產業，受到政策推動和多家廠商研發取得階段性進展，與技術授權等有利因素，使國內不少資金湧入生技產業，同時，許多生技公司亦結合金控公司與傳統產業，陸續成立生技基金，並針對國內外具有潛力之生技標的進行投資，皆有助於國內研發成果商品化之推動。
隨著台灣生技產業結構漸趨完善，營業額穩健成長，國內外廠商生技投資金額也逐年增加，未來將可以發展特色產品、催生指標型公司、擴大投資、人才培育等四大策略，以及運用政策/法規支援，強化外部資源引進等作法，擴大生技產業投資規模，以加速生技產業發展。
綠能發展獲國際肯定
在綠能產業方面，台灣在綠能產業發展上擁有著極佳的技術研發和製造能力，在2010年瑞士洛桑國際管理學院（International Institute for Management Development；IMD）對各國綠色科技創造競爭優勢之評比中，台灣列為全球第六位，亞洲排名第二，評分遠高於鄰國的新加坡、南韓及香港，顯示台灣綠色科技競爭優勢與綠能產業的發展成果已獲得國際肯定。
尤其是在太陽光電及LED照明產業方面，都已具經濟規模，台灣太陽光電產業上、中、下游加上周邊相關組件及材料等供應商，共計超過200家，多集中於太陽電池的生產，並成為全球第二大太陽能電池製造商；LED照明產業部份，台灣LED元件產業已建構出相對完整的價值鏈，不但在製程技術能力上晉升為全球領導地位，在技術上較中國更具優勢。
賴清德表示，從近兩年大台南生技綠能產業發展現況，不難看到這些產業優勢所在，以大台南生技綠能產業現況來說，生物科技企業有423家，其中以醫療器材產業223家最多，比重高達50％，次為新興生技產業121家，佔生技企業總家數比重29％，再次之為製藥產業79家，佔生技企業總家數比重19％。
生物科技經營業者主要集中在永康區、安南區、仁德區及南區，其中以永康區生技企業家數96家最多，另以安南區居次，為61家，再者為仁德區48家，南區43家排名第三、第四，以上四區企業家數加總，估計佔本市總生技企業家數58％，顯示生技聚落型態已逐漸成形，未來可透過異業結盟，加上環境、空間等因素，發展醫療器材產業，加速南市生物科技產業的發展。
生技聚落型態成形
綠能產業部分，南市綠色科技產業業者約200家廠商，其中包括太陽光電30餘家、LED照明上百家、風力發電2家、電動車輛13家、綠建築11家以及其它類10家；若以行政區為單位劃分，業者大多集中於仁德、永康、安南、善化、新市等區，顯見本市已逐漸形成綠色科技產業聚落；其中南科、南科工、樹谷園區、永康工業區、仁德工業區等更屬綠能產業之群聚所在。
其間，以台南轄區內的工業園區中來說，面積最大、產值最大，且高科技產業及人才聚集之台南科學園區來說，無論是家數及營業額方面，生技及綠能產業均呈現穩定成長，且占全園區廠商之40％，為該園區之主要產業廠商。
台南製藥領域發展空間大
賴清德強調，台南生技產業優勢，在於該產業的主體製藥產業來說，上中下游的產業鏈完整，從上游的原料、研發、臨床，到中游的製造、檢測、驗證，到下游的品牌行銷，其間廠商包括台灣漢藥、金穎生技、統一生化科技、台灣神隆、生達化學製藥、港香蘭藥廠、南光化學製藥、展旺生物科技等等知名廠商。
台南市製藥產業，從2007年的94億元，至2010年已成長至131億元，顯示台南的製藥產業與全國年成長幅度相比，高於1至2倍，代表台南在製藥領域，具有相當大的發展空間。
同時，在食品、特化生技產業中，已呈多元發展局面，包括傳統食品製造業、飲料業、化學製品製造業跨入生技產業。例如，統一集團所投資的統欣生技、台鹽實業跨入保健食品、港香蘭製藥則另成立港香蘭應用生技公司。
輔導措施四面向邁進
且在醫療器材產業次分類具領導地位，例如在眼鏡產業就有一個很大的群聚，並且從傳統產業擴張延伸。又如，從傳統紡織起家的宏遠公司，已跨入製造手術衣、不織布大廠的康那香公司，也已跨入製造醫療用隔離衣等，這些都是十足具在地台南生技產業特色。
此外，合併後的大台南的農業資源十分豐富，由於台南是傳統農業之都，極適合發展生技聚落，是引導農業轉型的絕佳契機。上游的研發資源：計有成大、嘉藥、南台、中華、遠東等設有生物科技中心之大學院校，以及研究單位中央研究院與工研院進駐台南，提供學術的專業人才；中游計有亞蔬中心、畜試所、水試所、糖試所、農改場等研發試驗單位，下游南科園區高鐵兩旁，已有生物科技廠商群聚，整個產業發展資源相當完整。
賴清德強調，儘管生技、綠能產業正蓬勃發展中，為了更上一層樓，輔導措施仍將分四個面向邁進，一、資源整合－持續推動產業聯盟，建構產官學研合作平台推動台南市生技聯合檢測平台試營運。二、經營環境－打造產業聚落、建構示範場域生技產業方面，打造產業聚落。
三、市場開拓－推廣轄區產品，創造更多商機協助轄內廠商共同參與國內外大型展覽及辦理大型博覽會或活動。
四、招商引資－完善產業發展用地加上產業支援系統，針對目標廠商進行客製化招商，以吸引產業到本市投資。
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